1．不能将专利等同于技术发明或技术创新

因为两者并不是一一对应的。很多技术发明不采用专利保护方式。但是重要的发明或创新，尤其是能够带来长期经济利益的发明，一般是要申请专利保护的。所以可以使用专利指标测度技术发展，但不可以绝对化。

2.专利申请的倾向在不同技术领域之间差别很大

有的领域技术变化速度很快，不适于采用专利方式取得保护，如电子信息领域，技术创新活动很活跃，但有许多不申请专利，而是尽快推向市场，通过先发优势取得经济回报。这样在不同领域之间进行比较时，对于数据的解释要很谨慎，对所分析行业的技术特点要有所了解。

专利不包括软件、组织方法等方面的发明，因此排除了服务业的技术创新。

3.各国专利制度的差异

由于各国专利制度的差异，各国发明专利的具体标准、审批程序等方面或多或少存在不同之处，不同国家的专利在质量上不完全相同。如美国专利和日本专利是两种典型，例如多项相互联系的技术发明只能申请一项美国专利，却可申请若干项日本专利。这样用不同国家专利数量进行比较，有时会带来很大偏差。如专利数量差距巨大，还可以说明问题；但如果在同一或相近数量级上，就难以给出确切结论。所以发达国家在做专利国际比较时，一般不用不同专利体系的数据，即各国专利数量，而是选择某一大型专利体系，如美国专利与商标局或欧洲专利局。但这又带来另一个问题，即所谓的“本土优势”，所以目前OECD正在建设“三方（美、欧、日）”专利数据库。

4.专利质量的差异